จัดโครงการอบรมเชิงปฏิบัติการเรื่อง ชีวสารสนเทศเบื้องต้นสำหรับงานด้านจุลชีววิทยา
คณะเทคนิคการแพทย์จัดโครงการอบรมเชิงปฏิบัติการเรื่อง
ชีวสารสนเทศเบื้องต้นสำหรับงานด้านจุลชีววิทยา (Workshop on Basic Bioinformatics for Microbiologist)
ระหว่างวันที่ 19 – 20 พฤษภาคม 2557 ณ คณะเทคนิคการแพทย์ ชั้น 3 ห้อง MT307
หลักการและเหตุผล
ในปัจจุบันเทคโนโลยีชีวสารสนเทศเข้ามามีบทบาทสำคัญในการศึกษาวิจัยในแง่ ต่างๆ อาทิ เช่น การศึกษาจีโนมมิกส์ โปรตีโอมิกส์ ทรานส์คริปโตมิกส์ เป็นต้น ในแง่การศึกษาวิจัยจุลชีพที่ก่อให้เกิดโรคเทคโนโลยีชีวสารสนเทศถูกนำมา ประยุกต์เพื่อศึกษาทั้งในระดับอณูชีววิทยาและระบาดวิทยาระดับโมเลกุลของโรค ติดเชื้อ ก่อให้เกิดข้อมูลทางอณูชีววิทยาที่เป็นประโยชน์ในการควบคุมและป้องกันโรค ระบาดต่างๆ ประเทศไทยเป็นแหล่งระบาดของเชื้อก่อโรคที่สำคัญหลายชนิด เช่น เชื้อ Mycobacterium tuberculosis, Burkholderia pseudomallei เป็นต้น
ดังนั้นจึงเป็นสิ่งสำคัญที่บุคลากรทั้งในด้านการแพทย์สาธารณสุข รวมถึง นักศึกษา นักวิจัยและผู้ที่เกี่ยวข้องควรมีความรู้ความเข้าใจเกี่ยวกับการนำเทคโนโลยี ชีวสารสนเทศมาประยุกต์ใช้เพื่อนำไปสู่การได้ข้อมูลอันเป็นประโยชน์แก่การควบ คุมโรคติดเชื้อในประเทศไทย
วัตถุประสงค์
- เพื่อ ให้ผู้เข้าอบรมได้มีความรู้และประสบการณ์ที่ทันสมัยในด้านเทคโนโลยีชีวสารส นเทศและสามารถนำไปใช้ประโยชน์ในงานวิจัย โดยเฉพาะการศึกษาวิจัยจุลชีพที่ก่อให้เกิดโรคทั้งในระดับอณูชีววิทยาและ ระบาดวิทยาระดับโมเลกุล
- เพื่อให้เกิดการแลกเปลี่ยนและถ่ายทอดประสบการณ์ระหว่างผู้เข้าร่วมประชุมวิชาการและวิทยากรผู้ทรงคุณวุฒิ
- เพื่อให้ผู้เข้าอบรมเรียนรู้และเข้าใจหลักการของเทคโนโลยีชีวสารสนเทศศาสตร์
- เพื่อ ให้ผู้เข้าอบรมสามารถนำความรู้ด้านเทคโนโลยีชีวสารสนเทศไปใช้สืบค้น ตลอดจนวิเคราะห์ข้อมูลต่าง ๆที่เกี่ยวข้องกับยีน และโปรตีน ซึ่งเป็นพื้นฐานนำไปสู่งานวิจัยประยุกต์ต่อไป
ค่าลงทะเบียน
สำหรับ นักศึกษาระดับบัณฑิตศึกษา เป็นจำนวนเงิน 700 บาท
สำหรับ นักวิจัย และบุคลากรทางการแพทย์ เป็นจำนวนเงิน 1,500 บาท
กำหนดการ
Workshop on Basic Bioinformatics for Microbiologists
Date&Time: May 19-20, 2014; 0900 – 1700 hrs.
Place: Faculty of Medical Technology, Prince of Songkla University, Hatyai, Songkhla, Thailand 90110, Room No: 307
Objectives:
This training course is designed to give graduate students, postdocs and microbiologists an understanding of basic bioinformatics for everyday use in microbial genetics and genomics. This course will also give the participants working knowledge of research on molecular epidemiological investigation of bacterial infectious diseases.
Contents and Schedules:
May 19, 2014:
0900 - 1200 hrs.
Lecture 1: Bacterial genomes and basic bioinformatics tools for microbiologists
Practice 1:
Part I: Genome viewers
The participants will be provided a hand on training on using genome browser and annotation tools such as Artemis and other web-based software to visualize microbial genomes.
Part II: Manipulation of DNA Sequences
The participants will learn basic techniques in editing, manipulating, and aligning DNA sequences. Software tool such as BioEdit (Ibis Biosciences Inc. USA) will be used.
1300 – 1700 hrs.
Lecture 2: Comparative genomics
Practice:
Part III: Genomic comparison tools
The participants will be trained on basic comparative genomics. Participants will be able to perform genomic alignments and identify genomic differences. Artemis Comparison Tool (ACT) will be used.
Instructor: Apichai Tuanyok, Ph.D.
Assistant Professor, Department of Tropical Medicine, Medical Microbiology and Pharmacology. Genome Microbiologist, Pacific Center for Emerging Infectious Diseases Research John A. Burns School of Medicine, University of Hawaii at Manoa, Honolulu, Hawaii, USA
E-mail: tuanyok@hawaii.edu
May 20, 2014:
0900 - 1000 hrs.
Lecture 3: Current trend in Laboratory Diagnosis of Tuberculosis
Instructor: Siroj Jitsurong, Ph.D.
Faculty of Medical Technology
Prince of Songkla University
E-mail: siroj.j@psu.ac.th
1000 - 1200 hrs.
Lecture 4: Application of bioinformatics in molecular epidemiology
- Current trend in tropical infectious disease
- Application of bioinformatics in molecular epidemiology of Tuberculosis.
1300 – 1700 hrs.
Practice
Part IV: Group assignments and discussion.
The participants will be assigned to analyze TB genome data. Each group will present and discuss their findings.
Instructor: Apichai Tuanyok, Ph.D.
Assistant Professor, Department of Tropical Medicine, Medical Microbiology and Pharmacology. Genome Microbiologist, Pacific Center for Emerging Infectious Diseases Research John A. Burns School of Medicine, University of Hawaii at Manoa, Honolulu, Hawaii, USA
E-mail: tuanyok@hawaii.edu
Registration: April 1st – May 15th, 2014
Student 700 THB
Researcher 1,5 00 THB
www.medtech.psu.ac.th, 074-2869102-4 FAX 074-289101
Donwnload :